สำนักงานสิ่งแวดล้อมและควบคุมมลพิษที่ 16 มีหน้าที่และอำนาจ ดังต่อไปนี้
- จัดทำแผนบจัดการคุณภาพสิ่งแวดล้อมด้านการจัดการมลพิษในระดับพื้นที่
- เสนอแนะการกำหนดมาตรฐานคุณภาพสิ่งแวดล้อม และมาตรฐานควบคุมมลพิษจากแหล่งกำเนิดในระดับพื้นที่
- ติดตาม ตรวจสอบ เฝ้าระวังคุณภาพสิ่งแวดล้อม และจัดทำรายงานสภานการณ์สิ่งแวดล้อมระดับพื้นที่
- ตรวจวัดและทดสอบตัวอย่างสิ่งแวดล้อมเพื่อบ่งชี้คุณภาพสิ่งแวดล้อม และการอ้างอิงตามมาตรฐาน
- ส่งเสริมการมีส่วนร่วมและเชื่อมโยงเครือข่ายด้านการจัดการมลพิษสิ่งแวดล้อม เผยแพร่ประชาสัมพันธ์ ให้ความรู้ คำแนะนำ และติดตามประเมินผลการจัดการมลพิษในระดับพื้นที่
- ดำเนินการตามกฎหมายว่าด้วยการส่งเสริมและรักษาคุณภาพสิ่งแวดล้อม และกฎหมายที่เกี่ยวข้องในระดับพื้นที่
- ดำเนินการเกี่ยวกับเรื่องร้องเรียนร้องทุกข์ ด้านมลพิษ และสนับสนุนการปฏิบัติการเหตุฉุกเฉินด้านมลพิษในพื้นที่
- ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่อธิบดีมอบหมาย
การแบ่งส่วนราชการภายใน
- ส่วนอำนวยการ
- ส่วนแผนสิ่งแวดล้อม
- ส่วนการจัดการกากของเสียและสารอันตราย
- ส่วนการจัดการคุณภาพน้ำ อากาศและเสียง
- ส่วนตรวจและบังคับใช้กฎหมาย
- ส่วนห้องปฏิบัติการวิเคราะห์สิ่งแวดล้อม